治疗腹泻的药物很多，但因为婴幼儿发育尚不完全，所以治疗婴幼儿腹泻时要注意。有些药物不适宜用来治疗婴幼儿腹泻。

四环素

具有广谱抗菌作用，治疗感染性腹泻具有一定疗效。但8岁以下小儿应用四环素及同类药物如土霉素、多西环素（强力霉素）、米诺环素（美满霉素）等可致恒齿感染、牙釉质发育不良和骨生长抑制，因此8岁以下的小儿应避免应用此类药物。

易蒙停（洛哌丁胺）

适用于各种病因引起的急慢性腹泻的治疗。但其作用强烈，用于低龄儿童易致药物不良反应，如影响中枢神经系统等，加之曾有新生儿用药致死的报道，故国内外均限制用于低龄儿，如我国易蒙停使用说明书中就规定：5岁以下儿童禁用。

氟哌酸（诺氟沙星）

对致病性和产毒性大肠杆菌、沙门菌属等所致的胃肠炎、菌痢有良好疗效，临床应用广泛，为人们熟知。但因该药及其同类（喹诺酮类）药物有引起骨病变的可能，因此，12岁以下小儿不宜选用。

复方地芬诺酯（复方苯乙哌啶）

适用于急慢性功能性腹泻又慢性肠炎的治疗。该药每片含盐酸地芬诺2.5mg、硫酸阿托品0.025mg，其中地芬诺酯对肠道作用类似吗啡，可直接作用于肠平滑肌，作用亦很强烈。由于国内外不断有应用该药致小儿中毒甚至致死的报道（死亡病例集中于小于两岁的婴幼儿），又因该药小儿用药剂量至今尚无统一标准，因此两岁以下婴儿禁用，两岁以上小儿应慎重使用（严格控制用药剂量）。

药用炭

能吸附导致腹泻及腹部不适的多种有毒与无毒刺激物，减轻对肠壁的刺激，减少蠕动，从而起到止泻作用。但由于该药吸附作用强助无选择性，对消化酶如胃蛋白酶、胰酶的生长活性均有影响，长期应用可致小儿营养不良，故3岁以下小儿腹泻或腹胀，禁止长期应用。